Jackie's research station

我上週把Jim的一小部份工作完成了，成就感蠻大的，因為要在一堆未知的資料內找到一些線索，並將它組織起來，是需要耗費非常多精力與想像的。我沒有特別去看甚麼文獻來去佐證，因為這篇會是第一篇跨不同樣區，扎扎實實用時間資料來講故事的一篇文章，真的是前無古人的一篇文章。也因為資料量很龐大，因此分析起來就必須要夠"大"，大範圍的思考，大方向的抓取，大尺度的探究。 我原本把這份資料弄得很難，以為要用很複雜的分析去呈現，但在某天的洗澡自言自語當中，突然發現，一道用很高級食材所做的料理，最重要的就是要把高級食材的味道凸顯出來。我很喜歡看澳洲頂級廚師，根本就是我在台灣閒暇時候，或是很忙的時候一定會停下來看的節目。很多使用高級食材料理的餐點，通常都是用最簡單的烹飪方式去呈現，方法越簡單就越能夠將食材本身的味道凸顯出來，反而用複雜的調味，則會把最純粹的味道蓋過。因此，面對全世界第一篇收集那麼多樣區又跨時間尺度的文章，更應該把最純粹的趨勢、最簡單的分析，將這些概念從空間延伸到時間去。 因此我抓了之前跟Jim討論的線索，從那邊下手，讓事情簡單化，讓圖表一目了然，讓一件事情很快的讓讀者抓到重點，而且要讓人有興趣引用。所以我寫了R Markdown把所有步驟記錄下來，我想要告訴Jim，我雖然寫英文文章可能不會很快，但我可以組織好這些code，讓這些code講我想要講的故事，讓這個code呈現出我想要做的圖表。 any figure? 這是上上周五Jim跑進來講的第一句話，我嚇到了，因為我甚麼東西都沒做，我當時星期四晚上還參加了一場日本的研討會，星期五在趕報告，下午他一進來，我便很慚愧地與他討論。最重要的是星期一他還又開了來回8小時的車，載我們出去看大樣區的樣子。因此，那一周，我根本是拚了命的把所有思緒集中在「要如何把東西生出來」上面。 最後很高興做出來了，而且是我自己也可以說服自己的結果。有時候自己的高標準也是會害死自己，但是也好像達成了某種成就。 礙於這是一篇未發表的重要文章，因此．．．就沒有甚麼過程，但卻是我滿滿的心得與驕傲，我很榮幸，我會寫code，雖然英文很爛，但我可以用其他語言來與其他人對話。

  今天美國的勞動節，學校以及大部分的商家與公車都是休假一天。原本想說實驗室的博後會去，那就去實驗室好了，結果在和實驗室博後確認完時間之後，Jim大概不到一個小時就問：要不要去猶他森林動態樣區?當天來回，早上六點出發，晚上可能要10點才能回來。 Jim 來信問我們要不要去猶他動態樣區 我看了一下，開車來回要9~10個小時，523公里。從台灣最北端到台灣最南端，也才484公里。於是我就厚臉皮說：「好啊」 從Logan到猶他動態樣區單趟需要4個小時 猶他森林動態樣區位在猶他州西南邊的Dixie National Forest內，整個樣區的大小15.5公頃，地表的岩石多是經過冰蝕作用後的沉積岩，主要的物種有Abies bifolia、Picea engelmannii、Pinus flexilis、Pinus longaeva等，而在開闊地常見闊葉樹則只有Populus tremuloides。我這裡面最愛Pinus longaeva，如果是中文翻譯的話會是大盆地刺果松，四到五針為一束，長度約2.5~4公分左右，短短小小胖胖軟軟摸起來爆幹舒服，重點是這個樹種易被火燒，但恢復利又夠強，會從旁邊長出萌蘗，抗壓性超高。另外Picea engelmannii 也是個適應火燒之後的樹種，在樣區裡面有很多高大的Picea engelmannii 都因為火燒之後死亡，但周圍的小樹多半是這個樹種，而且在這些高度2 m的植株上，就已經生產毬果開始散播種子，主要是因為小時候不做愛，長大會被燒死(踢飛)。這個地方的火燒週期大概是兩百年為一輪，自然發生，所以這邊的樹種都已經很適應這種壓力，甚至也都具有極高的耐旱性。 而另一個讓我覺得驚訝的是，在這個溫帶森林裡面，我竟然感受不到很舒服的感覺。第一個是地形，整個樣區的海拔落差有130公尺，除此之外加上南北向坡、大碎石與冰蝕沉積岩的地形，造就這個區域的地理環境異質性。再開過來的路上，Jim跟我說他們這個樣區完全不大受到中性理論的影響時我還有點不大相信，但親身從最低海拔走到最高海拔，爬了各種地形之後，也難怪他會有這樣的結果；而第二個是植株的密集程度很高(每20 x 20 m大概有200多棵的植株)，而且枝下高很低，或甚至根本沒有枝下高，所以要調查的時候就是要鑽進大樹欉裡，把周圍所有的樹量完之後，才能從樹叢堆裡爬出來。有種南仁山熱帶森林的既視感，但...